问题已经找到：
前提：Secure ship勾选烧写时，设备需要断电重启才能有效（单片机上的3.3V必须耗光）。
原因：设备断电的时间不够长导致，当设备断电后，3.3V会保持大概4S左右，而之前测试时都是断电后立马就上电，所以才会出问题。
题外话：
我的设备是支持IAP远程升级功能的，如果在IAP程序或是APP程序中加入下面的加密语句
if(FLASH_GetReadOutProtectionStatus() == RESET)
{
FLASH_Unlock();//This MUST done first
FLASH_ReadOutProtection(ENABLE);
FLASH_Lock();
}
，则会影响到升级功能，会报HardFault_Handler错误，具体什么原因没有去查明，所以才有了Secure ship勾选来加密的方案。
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楼主
