Molegro Virtual Docker v4.0.2 1CD计算机辅助药物设计软件
Molegro Vitual Docker --计算机辅助药物设计软件。是跨平台(Windows/MacOSX/Linux)的预测蛋白质跟化学小分子结合的
软件,软件提供在Docking过程中所需的所有功能,从分子结构的preparation到binding site的预测以及最后的小分子的结
合未知及构造 (conformation)。软件本身由最新的演算法,可以提供高准确性的docking结果,以及简单好用的视窗界面操
作。
Molegro Virtual Docking提供:
1、高准确性的docking结果,与其他docking软件想比较之下,为准确率最好的(MVD: 87%, Glide: 82%, Surflex: 75%,
FlexX: 58%)
2、简单易用的软件界面:提供互动步骤方法 (wizard),让使用者可以很快的设定及执行docking,也针对docking结果提供
完整的视觉及分析工具。
3、跨平台的整合:Molegro Virtual Docker 提供在Linux, Windows,及Mac平台的版本以及其结果可以在各平台存取
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软件提供Docking的互动步骤来进行Docking的计算,在互动模式中,可以提供:
选择哪些分子要进行Docking计算;
选择哪个键结区域来进行Docking计算(MVD)会先自动计算出有可能的binding pockets
设定演算法及计算过程的参数设定
管理及增加额外的限制条件
在计算的过程中检查计算过程中的错误状况
其他特征:
a. 可以在Mac (PowerPC及Intel), Linux (32-bit及64-bit), 及 Windows的平台执行
b. 提供巨集的功能
c. 提供客制化的分子表面及骨干的表示
d. Biomolecule generator可以转换PDB档案给软件来用
e. 提供文字标示分子的特性
f. 提供线上帮助及检查新版更新
g. 提供使用MVD本身的scripting language及其他程式语言(Python已经包含)
h. Pose Modifier可以提供使用者修改化学分子的结构
医学、医药方面软件
BIO-RAD PDQUEST v8.0.1 1CD(成像系统控制功能 + 二维凝胶分析功能 + 数据库管理功能 + Spot Cutter 切胶系统控制功
能 + 质谱数据反馈功能)
BIO-RAD QUANTITY ONE v22 1CD(1D凝胶定量软件)
BioSolveIT.LeadIT.v1.1.0 1CD(功能强大的FBLD/SBDD药物设计平台)
BioSolveIT.ReCore.v1.8.14-ISO 1DVD(生物技术设计工具)
BrainVoyager QX v2.0.7 1CD(在功能与结构上分析和可视化核磁共振图像数据集的软件包)
Calcusyn.v2.0 1CD(准确的分析联合用药作用,能够自动量化现象如协同和抑制作用)
CLC.Genomics.Workbench.v3.6.5 1CD(综合性基因分析系统)
CLC.Genomics.Workbench.v3.6.5.Linux 1CD
Cytel.East.v5.0 1CD(医学临床试验设计系统)
DHAL.ViewBox.3.1.1.14 1CD
Dnastar.Lasergene.v7.1.Win2KXP 1CD(生物医学软件,用作DNA和蛋白质序列分析、重叠群拼接和基因工程管理)
Dnastar.Lasergene.v7.1.0.Proper 1CD
FieldAlign v1.0.2 1CD
FieldTemplater v2.0.1 1CD
Gastroplus v7.0-ISO 1CD(基于机制性生理模型的药代动力学、药效动力学(PBPK/PD)模拟软件)
InteLigand.LigandScout.v2.03.Linux 1CD
InteLigand.LigandScout.v2.03.MacOSX 1CD
Life.Sciences.Clinical.Genomics.Assimilation.Module.v3.2 1CD(用于进行临床医学基因组研究的分析软件。
Life.Sciences.Clinical.Genomics.HL7.CDA.Builder.v3.2 1CD 它们分别用于序列识别,特定基因构建等功能)
Life.Sciences.Clinical.Genomics.Universal.De-identification.Platform.v3.2 1CD
Materialise Simplant Pro v11.04 1CD(CT资料转化3D图像工具)
Merge.eFilm.Workstation.v2.1.2+用户手册 1CD(在医学图像处理领域排在首位的诊断和处理工具。它可以同时
检查多个图像,进行相互参考,测量,旋转,缩放和注释)
MedCalc.v12.2.1.0.Win32 1CD
MedCalc.v12.2.1.0.Win64 1CD
MestREC.v4.9.9.9 1CD(提供数据处理、可视化和分析高分辨率的核磁共振数据的功能)
MestRES.v1.12 1CD
Molecular.Biology.Insights.Oligo.v7.51 1CD
Molecular.Operating.Environment.v2008.10-ISO 1DVD(药物研发)
Netter.Interactive.Atlas.Of.Human.Anatomy.v3.0-ISO 1CD(解剖互动软件)
Orthocrat.TraumaCAD.v2.0-ISO 1CD(外科手术CAD)
Vector.NTI.Advance.v10.0 1CD(综合性蛋白核酸分析工具包)
Vitrea 2 v3.7 for Win95_98_NT-ISO 1CD(心脏功能分析)
Sante.DICOM.Editor.v1.0.21 1CD(DICOM编辑器,医学用软件,可以查看,处理以及编辑任何形态的DICOM图像的工具)
Sante.DICOM.Viewer.Pro.v1.0.21 1CD(DICOM查看器,医学用软件,可以查看DICOM图像的工具)
Schrodinger Suite 2011 Update1 Win32-ISO 1DVD(解决药物研究中挑战的完整软件套装) 软件带有升级包
Schrodinger Suite 2011 Update1 Win64-ISO 1DVD
Simpleware.ScanIP.ScanFE.ScanCAD.v3.1.WinNT_2K 1CD(口腔外科医学分析软件)
Tripos.Muse.v1.3 1CD(全新药物设计)
Tripos.SYBYL-X.v2.0.0.11273.Windows-ISO 1CD(分子模拟软件)
Tripos.SYBYL-X.v2.0.0.11273.Linux32_64-ISO 1DVD
Tripos.SYBYL-X.ORCHESTRAR.Databases.v0808.231-ISO 1DVD
Tripos.SYBYL-X.PRODAT.Database.v0808.231-ISO 1DVD
Tripos.Sybyl.v7.3.Unix-ISO 4CD+1DVD
Tripos.Sybyl.v8.0.SP6.Update.Only.Linux & Irix 1CD
Tripos.Sybyl.v8.0.Linux & Irix-ISO 1CD+2DVD(SYBYL软件包,Tripos出品的专业分子模拟平台,涵盖了分子模拟与显示
、定量构效
关系和ADME、药效团模型、生物信息学、基于结构的药物设计、化学信息
学和数据库、
组合化学和分子多样性、NMR数据处理、化合物实体提供等多种与药物研
究和开发相关的
方向,为用户提供全面的药物设计和生物化学研究的解决方案) |