在MPLAB® X IDE中可以对一个包含同一套源文件的单个项目设置多种不同的配置，从而方便地实现将一个项目的同一套源文件按不同方式进行编译和调试/编程。每一种“配置”都可以有自己的目标器件型号、硬件调试/编程器、编译器、以及编译器选项。设置多种不同的配置通过项目属性对话框进行，在项目属性对话框中点击“Manage Configurations...",在弹出窗口中点击“New”创建新的配置，再回到项目属性对话框种对新创建的配置进行选项设置。设置好多种配置后，可以在MPLAB X IDE工具栏中的“项目配置下拉框”进行配置选择，也可以在“Manage Configurations..."中选择一种配置并“Set Active”作为当前有效配置。
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