库函数GPIO_PinRemapConfig就是用来重映射使用的啊。
就拿你说的TIM3-CH1如果没有映射的时候对应PA6。
TIM3-CH1如果部分重映射的对应PB4，使用下面的库函数设置：
GPIO_PinRemapConfig(GPIO_PartialRemap_TIM3, ENABLE); //Timer3部分重映射TIM3_CH1->PB4
TIM3-CH1如果完全重映射的对应PC6，使用下面的库函数设置：
GPIO_PinRemapConfig(GPIO_FullRemap_TIM3, ENABLE); //Timer3完全重映射 TIM3_CH1->PC6
这种用来一般在F1系列使用，在F4重映射的使用下面的函数：
void GPIO_PinAFConfig(GPIO_TypeDef* GPIOx, uint16_t GPIO_PinSource, uint8_t GPIO_AF)
{
uint32_t temp = 0x00;
uint32_t temp_2 = 0x00;
/* Check the parameters */
assert_param(IS_GPIO_ALL_PERIPH(GPIOx));
assert_param(IS_GPIO_PIN_SOURCE(GPIO_PinSource));
assert_param(IS_GPIO_AF(GPIO_AF));
temp = ((uint32_t)(GPIO_AF) << ((uint32_t)((uint32_t)GPIO_PinSource & (uint32_t)0x07) * 4)) ;
GPIOx->AFR[GPIO_PinSource >> 0x03] &= ~((uint32_t)0xF << ((uint32_t)((uint32_t)GPIO_PinSource & (uint32_t)0x07) * 4)) ;
temp_2 = GPIOx->AFR[GPIO_PinSource >> 0x03] | temp;
GPIOx->AFR[GPIO_PinSource >> 0x03] = temp_2;
}
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